随着B超技术的提高及人们对于甲状腺结节的警惕性的提高，越来越多的没有任何症状和体征的人们都发现了大大小小的甲状腺结节，在一定范围内造成了人们的迷茫和焦虑。
实际上对于大部分B超发现的甲状腺结节的“病人”都没有明显的症状和体征，在一段时间内也没有什么危害，其实也不需要进行非常独特的处理。在临床上其核心问题是这些结节是良性的还是恶性的？但是这是一个非常复杂而很难讲清楚的问题。
首先从处理来讲，如果判断结节是恶性的，那么需要进行手术，手术之后需要进行比较长时间的治疗；如果判断结节是良性的，就只是进行观察就可以了，如果越来越像恶性的，就需要手术，如果临床判断更像是良性的，那么就继续观察，而没有什么药物可以进行有关的治疗。
从临床特点来看：良性的甲状腺结节也会逐步的增大，只是没有恶性的速度快，而且良性结节切除后，也有可能还会重新生长出来，当然，良性的甲状腺结节不会转移，因此，对于甲状腺结节附近的淋巴结进行观察。但是，颈部淋巴结肿大并不能判断为一定是甲状腺癌的转移，很大颈部淋巴结肿大有可能是由于良性的炎症反应。当然，如果真的颈部淋巴结有明确的转移时，甲状腺癌可能就是很晚期了，治疗效果很一般，是需要在临床诊断上尽量避免的情况。
很多时候甲状腺结节是多发的，到目前为止，主流的观点还是认为多发性的甲状腺结节反而是良性的可能性大，尤其是年轻或者中年男性独立的甲状腺结节反而要更小心可能是恶性肿瘤，而在女性发生的多发性的甲状腺结节，反而更倾向于良性。
现在也有很多B超医生特别注意甲状腺结节中的“钙化灶”，没有钙化灶的结节更倾向于良性，而有大的钙化灶也比较倾向于良性，而细小的钙化灶，是甲状腺癌的重要的标志之一。随着技术的发展，也有医师反对这种推测，认为细小钙化灶也不完全是恶性肿瘤的标志，还需要结合其他的临床特点，才能做出更准确的判断。
也有些肿瘤标志物对于甲状腺癌有一定的提示作用，尤其是降钙素(Calcitonin)和癌胚抗原(CEA)是甲状腺髓样癌的比较特异性的表现，但可惜的是这两个指标特异性比较高而敏感性比较差，作为肿瘤的早期诊断指标，我们更加希望敏感性强的指标，即使这样，由于甲状腺髓样癌的恶性程度比较高而且需要确定是否是多发性内分泌肿瘤综合征，因此如果B超提示甲状腺结节是恶性肿瘤的时候，更需要进行降钙素和癌胚抗原的检查。
另外，同位素对于甲状腺结节的诊断意义也没有之前认为得那么大，比如：现在已经几乎不用热结节、凉结节和冷结节等来鉴别良性还是恶性甲状腺结节，因为现在发现临床上与之前的结论相差甚远，如热结节中也有不少的恶性肿瘤，而凉结节中也有很多是良性结节。
对于结节的硬软程度对于良恶性肿瘤的意义也有质疑，目前更多地为结节的硬软的程度与结节内的细胞成分和纤维成分的比例关系更密切。
总之，用临床特点及B超结果对于大部分甲状腺结节的良恶性判断都不是非常明确，一般认为：男性、单发、大结节（2cm）、无压痛、分界不清晰、有钙化（尤其是细小钙化灶）、有淋巴结转移、降钙素及CEA升高、生长比较快、血运比较丰富等特点，尤其是符合的特点越多，甲状腺恶性肿瘤的可能性越大，也需要尽快手术或者进行甲状腺穿刺。