市一院核医学科是一个利用放射性核素来诊断、治疗疾病的具有明显专科特色的科室。科室房屋建筑、设备配置、项目开展等情况均处于云南省前列，安装SPECT/CT和PET/CT，其中PET/CT为云南省州市一级医疗单位首家安装并投入临床应用的科室。常规开展甲亢、甲减、桥本氏甲状腺炎、亚甲炎、甲状腺结节等疾病的筛查、治疗等工作。其中最具专科特色的是：碘治疗甲亢；碘治疗分化型甲状腺癌；89锶治疗恶性肿瘤骨转移；32磷敷贴治疗血管瘤、慢性湿疹、瘢痕疙瘩等；云克治疗甲亢性突眼、类风湿性关节炎、痛风、强直性脊柱炎、骨关节病等。开展甲功、性腺、HCG、肿瘤标志物、AMH（卵巢功能）等项目检测。